（1）显性基因通常用大写字母表示，隐性基因用小写字母表示．因此，图中的A表示显性基因，a表示隐性基因．

　　（2）在亲代的生殖细胞形成过程中，经过减数分裂，染色体彼此分离，每对染色体中的一条进入精子或卵细胞中，基因也随着染色体的分离而进入不同的生殖细胞中．受精卵中的细胞核中的基因一半来自母方，一半来自父方．因此，如果A来自父方，则a来自母方．

　　（3）如果父母双方的基因组成都是Aa，其遗传图解如图：从图解中可以看出他们子女的基因组成可能有3种，分别是AA或Aa或aa，子女中出现aa的几率是25%，即1/4．

　　生物的亲代与子代之间以及子代的个体之间在性状上的差异叫变异．按照变异的原因可以分为可遗传的变异和不遗传的变异，可遗传的变异是由遗传物质改变引起的，可以遗传给后代；由环境改变引起的变异，是不遗传的变异，不能遗传给后代．因此，父母双方的基因组成都是Aa，而子女中出现aa，体现了亲代与子代之间性状上的差异，因此这在遗传学上称为变异，它是由于遗传物质发生改变引起的，所以是可遗传的变异．

　　故答案为：

　　（1）显性；隐性；

　　（2）母方；

　　（3）3；25%；可遗传的变异．