（1）夜晚时没有光照，光反应不能正常进行，无法为暗反应提供所需的ATP、[H]，因此植物A夜晚不能合成C6H12O6．白天气孔关闭，液泡中的苹果酸经脱羧作用释放CO2用于光合作用植物A进行光合作用，同时细胞有氧呼吸产生的CO2也能用于光合作用，因此可来源于液泡和线粒体两种细胞器．

　　（2）由于A细胞的CO2是由细胞内部提供，故C5含量与环境中二氧化碳浓度无关，因此没有变化；而B细胞吸收的CO2减少，同时C5消耗减少，短时间内其来路不变，因此细胞的叶绿体中C5含量增加．

　　（3）植物叶片的气孔既是吸收CO2的通道，也是水分蒸腾的通道．植物A夜间气孔开放，吸收的CO2生成苹果酸储存在液泡中，而白天气孔关闭，液泡中的苹果酸经脱羧作用释放CO2用于光合作用，这说明植物A是在炎热干旱的环境中生存的，白天关闭气孔是它保存水分的生存策略，这也是长期自然选择的结果．

　　（4）如果用图2所示的装置来探究光照强度和光合作用速率的关系，且测量指标为装置中O2含量的变化，为排除环境等因素即CO2的浓度对实验的影响，故需将小烧杯中的蒸馏水换成CO2缓冲液或碳酸氢钠溶液．为使测得O2的变化量更精确，还应再设置对照，该实验探究光照强度和光合作用速率的关系，故实验变量是否进行光合作用，故对照组设计方法为该装置的容器和小烧杯中应分别放入死的植物幼苗和CO2缓冲液．

　　故答案为：

　　（1）没有光照，光反应不能正常进行，无法为碳反应提供所需的ATP、NADPH      呼吸作用产生的CO2和苹果酸经脱羧作用释放的

　　（2）植物A基本不变，植物B上升    

　　（3）炎热干旱  长期自然选择

　　（4）将小烧杯中的蒸馏水换成CO2缓冲液或碳酸氢钠溶液     该装置的容器和小烧杯中应分别放入死的植物幼苗和CO2缓冲液